宇宙中的螺旋星系有颗美丽的星球——纳斯星球，星球上有一种神奇的果实，一直保护着整个纳斯星的生态平衡。　　星球上的阿吉亚部落世世代代都守护着神之树，可是纳斯星上突然潜入了许多宇宙海盗，恰巧赛尔号上的先锋小队成员赛小息，阿铁打，卡璐璐途经此地，他们立刻加入了这场战斗…随着战况升级，四位神奇精灵：电系王者雷伊，暗影之王布莱克，武斗勇士盖亚，绝地武士卡修斯也加入了进来……...

本季讲述了赛尔号在得到无尽能源后，踏上回地球的归途完成使命；不料却因为遇到三巨头的阻碍，失控的赛尔号意外误入了传说中恐怖的巴斯星。在危机四伏的巴斯星上，挥之不去的阴霾，述说着龙族的往事，精灵帕罗狄亚以及哈莫雷特的种种恩怨…… 　　不过所有人努力下，帕罗狄亚与哈莫雷特这对好友最后得以重归于好。战神联盟全新集结加入新成员缪斯。当赛尔号抵达恶魔星后，得知星灵王为守护恶魔星牺牲，恶灵三巨头却将恶灵兽再次放...

公元1633年，大明水师最年轻旗总路长风护送东厂督公下南洋缉拿要犯，遭遇海兽舰队袭击，全军覆没。路长风被一神秘组织所救，随之来到大航海时代国际贸易中心-吕宋岛。岛民们在大明奇人宋应醒的引领下，建立世界融合城市“万国”，反抗西班牙殖民者的残酷统治。出于调查目的，路长风加入宋应醒的组织“天工”，与万国的奇人异士一起对抗殖民者和海上入侵势力。种种领先于时代的发明创造在此登场，令人叹为观止……在历史与现实...